<\/p>\n
Les scientifiques biom\u00e9dicaux s’efforcent d’identifier les g\u00e8nes qui contribuent \u00e0 la maladie, dans l’espoir que ces d\u00e9couvertes m\u00e8neront \u00e0 des traitements ciblant les bons g\u00e8nes et aideront le corps \u00e0 retrouver la sant\u00e9.<\/p>\n
Lorsqu\u2019un g\u00e8ne d\u00e9fectueux est responsable, la voie \u00e0 suivre pour comprendre le probl\u00e8me peut \u00eatre assez directe. De nombreuses conditions sont cependant beaucoup plus compliqu\u00e9es. Dans ces cas, plusieurs g\u00e8nes, parfois m\u00eame des milliers, jouent un r\u00f4le, et il devient beaucoup plus difficile de d\u00e9terminer comment ils sont li\u00e9s \u00e0 la maladie.<\/p>\n
Une nouvelle approche de cartographie g\u00e9nomique pourrait rendre ce d\u00e9fi plus facile \u00e0 relever. Dans un Nature<\/em> Dans cette \u00e9tude, des chercheurs des instituts Gladstone et de l’universit\u00e9 de Stanford ont utilis\u00e9 une vaste strat\u00e9gie qui teste l’impact de chaque g\u00e8ne dans une cellule, reliant les maladies et autres traits aux syst\u00e8mes g\u00e9n\u00e9tiques sous-jacents qui les fa\u00e7onnent. Les cartes r\u00e9sultantes pourraient \u00e9liminer la confusion dans la biologie et mettre en lumi\u00e8re les g\u00e8nes les plus susceptibles d\u2019\u00eatre des cibles utiles pour de nouvelles th\u00e9rapies.<\/p>\n “Nous pouvons d\u00e9sormais examiner chaque g\u00e8ne du g\u00e9nome et avoir une id\u00e9e de la fa\u00e7on dont chacun affecte un type de cellule particulier”, d\u00e9clare Alex Marson, chercheur principal de Gladstone, MD, PhD, directeur de Connie et Bob Lurie de l’Institut Gladstone-UCSF d’immunologie g\u00e9nomique, qui a co-dirig\u00e9 l’\u00e9tude. “Notre objectif est d’utiliser ces informations comme une carte pour acqu\u00e9rir de nouvelles connaissances sur la mani\u00e8re dont certains g\u00e8nes influencent des traits sp\u00e9cifiques.”<\/p>\n Trouver le \u00ab\u00a0pourquoi\u00a0\u00bb derri\u00e8re le risque g\u00e9n\u00e9tique<\/strong><\/p>\n Pendant des ann\u00e9es, les scientifiques se sont largement appuy\u00e9s sur des \u00ab\u00a0\u00e9tudes d’association \u00e0 l’\u00e9chelle du g\u00e9nome\u00a0\u00bb, qui analysent l’ADN de milliers de personnes pour trouver des liens statistiques entre les diff\u00e9rences et les traits g\u00e9n\u00e9tiques, y compris le risque de maladie. Ces efforts ont g\u00e9n\u00e9r\u00e9 d\u2019\u00e9normes ensembles de donn\u00e9es, mais il peut \u00eatre difficile de transformer ces signaux en explications biologiques claires, en particulier pour les caract\u00e8res influenc\u00e9s par de nombreux g\u00e8nes.<\/p>\n “M\u00eame avec ces \u00e9tudes, il reste un \u00e9norme foss\u00e9 dans la compr\u00e9hension de la biologie des maladies au niveau g\u00e9n\u00e9tique”, d\u00e9clare le premier auteur Mineto Ota, MD, PhD. Ota est chercheur postdoctoral au laboratoire Gladstone de Marson, ainsi qu’au laboratoire du scientifique Jonathan Pritchard, PhD de Stanford. “Nous comprenons que de nombreuses variantes sont associ\u00e9es \u00e0 la maladie ; nous ne comprenons tout simplement pas pourquoi.”<\/p>\n Mineto le compare \u00e0 une carte avec un point de d\u00e9part et un point final clairs, mais aucun itin\u00e9raire reliant les deux.<\/p>\n “Pour comprendre des traits complexes, nous devons vraiment nous concentrer sur le r\u00e9seau”, explique Pritchard, professeur de biologie et de g\u00e9n\u00e9tique \u00e0 Stanford, qui a codirig\u00e9 l’\u00e9tude avec Marson. “Comment pensons-nous \u00e0 la biologie quand des milliers et des milliers de g\u00e8nes, avec de nombreuses fonctions diff\u00e9rentes, affectent tous un trait ?”<\/p>\n Combiner des exp\u00e9riences cellulaires avec des donn\u00e9es d\u00e9mographiques massives<\/strong><\/p>\n Pour approfondir ce probl\u00e8me de r\u00e9seau, les chercheurs ont extrait des informations de deux bases de donn\u00e9es.<\/p>\n Un ensemble de donn\u00e9es provenait d\u2019une lign\u00e9e cellulaire de leuc\u00e9mie humaine couramment utilis\u00e9e pour \u00e9tudier les caract\u00e9ristiques des globules rouges. Dans des travaux ant\u00e9rieurs, un chercheur du MIT qui n’\u00e9tait pas impliqu\u00e9 dans cette \u00e9tude avait d\u00e9sactiv\u00e9 chaque g\u00e8ne de cette lign\u00e9e cellulaire, un \u00e0 la fois, et avait suivi comment la perte de ce g\u00e8ne modifiait l’activit\u00e9 g\u00e9n\u00e9tique.<\/p>\n L’\u00e9quipe de Marson a ensuite associ\u00e9 ces r\u00e9sultats aux donn\u00e9es de la UK Biobank, qui comprennent des s\u00e9quences g\u00e9nomiques de plus de 500 000 personnes. Ota a recherch\u00e9 des individus pr\u00e9sentant des mutations g\u00e9n\u00e9tiques qui r\u00e9duisaient la fonction des g\u00e8nes de mani\u00e8re \u00e0 modifier leurs globules rouges.<\/p>\n La r\u00e9union des deux sources a permis aux chercheurs de dresser une carte d\u00e9taill\u00e9e des r\u00e9seaux de g\u00e8nes qui influencent les caract\u00e9ristiques des globules rouges. Le tableau qui s\u2019en d\u00e9gage montre un paysage g\u00e9n\u00e9tique remarquablement complexe. Avec cette approche, ils pouvaient voir le point de d\u00e9part, la destination et l\u2019ensemble complexe de connexions entre les deux.<\/p>\n Ils ont \u00e9galement d\u00e9couvert que certains g\u00e8nes affectent plusieurs processus biologiques en m\u00eame temps, affaiblissant certaines activit\u00e9s tout en en augmentant d\u2019autres. Un exemple est SUPT5H, un g\u00e8ne associ\u00e9 \u00e0 la b\u00eata-thalass\u00e9mie, un trouble sanguin qui perturbe la production d\u2019h\u00e9moglobine et peut entra\u00eener une an\u00e9mie mod\u00e9r\u00e9e \u00e0 s\u00e9v\u00e8re. Les chercheurs ont connect\u00e9 SUPT5H \u00e0 trois programmes cl\u00e9s sur les cellules sanguines\u00a0: la production d\u2019h\u00e9moglobine, le cycle cellulaire et l\u2019autophagie. Ils ont \u00e9galement montr\u00e9 comment le g\u00e8ne influence chaque programme, en augmentant ou en r\u00e9duisant l’activit\u00e9 du g\u00e8ne.<\/p>\n “SUPT5H r\u00e9gule les trois voies principales qui affectent l’h\u00e9moglobine”, explique Pritchard. “Il active la synth\u00e8se de l’h\u00e9moglobine, ralentit le cycle cellulaire et ralentit l’autophagie, qui ont ensemble un effet synergique.”<\/p>\n Pourquoi cette m\u00e9thode de cartographie pourrait \u00eatre importante pour l’immunologie<\/strong><\/p>\n \u00catre capable de r\u00e9v\u00e9ler les voies g\u00e9n\u00e9tiques d\u00e9taill\u00e9es qui contr\u00f4lent le fonctionnement des cellules pourrait remodeler \u00e0 la fois la biologie fondamentale et le d\u00e9veloppement de m\u00e9dicaments.<\/p>\n Bien que l\u2019\u00e9quipe ait identifi\u00e9 de multiples fa\u00e7ons dont les r\u00e9seaux de g\u00e8nes fa\u00e7onnent le comportement des cellules sanguines, le plus important reste l\u2019outil lui-m\u00eame. Le groupe de recherche, et potentiellement de nombreux autres scientifiques, peuvent d\u00e9sormais appliquer la m\u00eame strat\u00e9gie \u00e0 d\u2019autres types de cellules humaines pour d\u00e9couvrir les mod\u00e8les mol\u00e9culaires \u00e0 l\u2019origine des maladies.<\/p>\n Pour le laboratoire Marson, qui se concentre sur les cellules T et d\u2019autres parties du syst\u00e8me immunitaire, la m\u00e9thode pourrait ouvrir la porte \u00e0 bien d\u2019autres d\u00e9couvertes.<\/p>\n “La charge g\u00e9n\u00e9tique associ\u00e9e \u00e0 de nombreuses maladies auto-immunes, d\u00e9ficits immunitaires et allergies est en grande partie li\u00e9e aux cellules T”, explique Marson. “Nous sommes impatients de d\u00e9velopper des cartes d\u00e9taill\u00e9es suppl\u00e9mentaires qui nous aideront \u00e0 vraiment comprendre l’architecture g\u00e9n\u00e9tique derri\u00e8re ces maladies \u00e0 m\u00e9diation immunitaire.”<\/p>\n L’\u00e9tude, \u00ab Mod\u00e9lisation causale des effets g\u00e9n\u00e9tiques des r\u00e9gulateurs aux programmes et aux traits \u00bb, para\u00eet dans le num\u00e9ro du 10 d\u00e9cembre 2025 de Nature. Les auteurs incluent : Mineto Ota, Jeffrey Spence, Tony Zeng, Emma Dann, Nikhil Milind, Alexander Marson et Jonathan Pritchard. Cette recherche a \u00e9t\u00e9 financ\u00e9e par les National Institutes of Health, la Fondation Simons, le Lloyd J. Old STAR Award, le Parker Institute for Cancer Immunotherapy, l’Innovative Genomics Institute, la Larry L. Hillblom Foundation, le Northern California JDRF Center of Excellence, la famille Byers, K. Jordan, la CRISPR Cures for Cancer Initiative, la Astellas Foundation for Research on Metabolic Disorders, la Chugai Foundation for Innovative Drug Discovery Science et l’EMBO. Bourse postdoctorale.<\/p>\n<\/div>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" Les scientifiques biom\u00e9dicaux s’efforcent d’identifier les g\u00e8nes qui contribuent \u00e0 la maladie, dans l’espoir que ces d\u00e9couvertes m\u00e8neront \u00e0 des traitements ciblant les bons g\u00e8nes et aideront le corps \u00e0 retrouver la sant\u00e9. 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